Fugaku ingin dia memata-matai Hokage Ketiga, dan Danzo ingin dia mengawasi klan Uchiha saat mereka merencanakan kudeta untuk menggulingkan kepemimpinan Konoha.
Itachi menemukan bahwa kudeta dapat menyebabkan perang Ninja lain. Jadi, Itachi mulai memata-matai klan Uchiha alih-alih memberikan informasi kepada Hokage Ketiga dan Tetua Konoha.
Selama waktu ini, Itachi mulai bertingkah aneh, tidak menghadiri pertemuan klan, berbicara menentang klan.
Baca Juga: Sinopsis Anime Shuumatsu no Harem: 5 Pria Tersisa di Bumi dengan Misi Menghamili Wanita
Itachi menjadi tersangka utama atas pembunuhan Shisui Uchiha, tetapi pada kenyataannya, ia menenggelamkan dirinya di Sungai Naka, mempercayakan Mangekyou Sharingan yang tersisa kepada Itachi. Yang lainnya dicuri oleh Danzo.
Saat itulah Itachi membuka Mangekyou Sharingan miliknya. Itachi juga membantu Shisui dalam memimpin klan untuk percaya bahwa matanya hancur. Karena ini, klan kehilangan harapan pada Itachi.
Di tengah semua ini, upaya Hokage Ketiga untuk merundingkan akhir tanpa pertumpahan darah dari permusuhan antara dua pihak terbukti tidak efektif.
Baca Juga: Daftar Anime Paling Populer Tahun 2021: Demon Slayer, Attack on Titan hingga Tokyo Revengers
Melawan keinginan Hokage Ketiga, Danzo dan Tetua Konoha memerintahkan Itachi untuk memusnahkan klan Uchiha.
Itachi menghapus seluruh klannya, hanya meninggalkan Sasuke sebagai satu-satunya yang selamat.